Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PUS3Q9BZE2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PUS3Q9BZE2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PUS3Q9BZE2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms