Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC46A2Q9BY10 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A2Q9BY10 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms