Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TDRD1Q9BXT4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD1Q9BXT4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms