Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDCA4Q9BXL8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDCA4Q9BXL8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms