Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRIP1Q9BX63 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BRIP1Q9BX63 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRIP1Q9BX63 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms