Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP4Q9BWG4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP4Q9BWG4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms