Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDC1Q9BTX1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDC1Q9BTX1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms