Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UPK3BQ9BT76 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UPK3BQ9BT76 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms