Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG101Q9BSB4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG101Q9BSB4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG101Q9BSB4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG101Q9BSB4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG101Q9BSB4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG101Q9BSB4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATG101Q9BSB4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG101Q9BSB4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG101Q9BSB4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ATG101Q9BSB4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATG101Q9BSB4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG101Q9BSB4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG101Q9BSB4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG101Q9BSB4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG101Q9BSB4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG101Q9BSB4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATG101Q9BSB4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG101Q9BSB4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG101Q9BSB4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG101Q9BSB4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms