Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP3BQ9BS92 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms