Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPKQ9BS16 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPKQ9BS16 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms