Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC39A3Q9BRY0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms