Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00467Q9BRT7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00467Q9BRT7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00467Q9BRT7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00467Q9BRT7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms