Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LARP6Q9BRS8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LARP6Q9BRS8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LARP6Q9BRS8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms