Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TXNDC17Q9BRA2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC17Q9BRA2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms