Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP3Q9BQQ7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RTP3Q9BQQ7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms