Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA1CQ9BQE3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms