Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMIM7Q9BQ49 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMIM7Q9BQ49 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms