Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RBM4BQ9BQ04 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RBM4BQ9BQ04 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms