Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP1Q9BPW8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP1Q9BPW8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NIPSNAP1Q9BPW8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NIPSNAP1Q9BPW8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms