Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF15Q99988 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDF15Q99988 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms