Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCL13Q99616 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCL13Q99616 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms