Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF4Q99607 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ELF4Q99607 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms