Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SORT1Q99523 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORT1Q99523 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms