Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAP1L3Q99457 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NAP1L3Q99457 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms