Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHOX2BQ99453 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHOX2BQ99453 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHOX2BQ99453 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms