Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RUFY1Q96T51 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RUFY1Q96T51 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUFY1Q96T51 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms