Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST8

CEP89, Centrosomal protein of 89 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP89Q96ST8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CEP89Q96ST8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP89Q96ST8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP89Q96ST8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms