Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN18Q96SJ8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN18Q96SJ8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms