Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPS6KC1Q96S38 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPS6KC1Q96S38 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms