Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
IFT140Q96RY7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC37.94■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC37.91■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
IFT140Q96RY7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
IFT140Q96RY7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
IFT140Q96RY7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms