Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC85AQ96PX6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85AQ96PX6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85AQ96PX6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms