Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNGAP1Q96PV0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNGAP1Q96PV0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms