Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIC6Q96NY7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIC6Q96NY7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms