Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SAMD11Q96NU1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SAMD11Q96NU1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SAMD11Q96NU1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms