Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC43Q96MW1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC43Q96MW1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms