Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIPOR3Q96MK2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIPOR3Q96MK2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPOR3Q96MK2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPOR3Q96MK2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPOR3Q96MK2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPOR3Q96MK2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPOR3Q96MK2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPOR3Q96MK2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms