Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCMTD1Q96MG8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCMTD1Q96MG8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms