Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRIMPOLQ96LW4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRIMPOLQ96LW4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIMPOLQ96LW4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIMPOLQ96LW4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIMPOLQ96LW4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIMPOLQ96LW4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIMPOLQ96LW4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIMPOLQ96LW4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIMPOLQ96LW4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRIMPOLQ96LW4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms