Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PHACTR3Q96KR7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PHACTR3Q96KR7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms