Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC35E1Q96K37 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms