Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VCPIP1Q96JH7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCPIP1Q96JH7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VCPIP1Q96JH7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms