Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LOXL4Q96JB6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LOXL4Q96JB6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms