Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC11Q96J66 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ABCC11Q96J66 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ABCC11Q96J66 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ABCC11Q96J66 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms