Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LIN37Q96GY3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIN37Q96GY3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms