Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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RNF185Q96GF1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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RNF185Q96GF1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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RNF185Q96GF1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RNF185Q96GF1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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RNF185Q96GF1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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RNF185Q96GF1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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RNF185Q96GF1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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RNF185Q96GF1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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RNF185Q96GF1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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RNF185Q96GF1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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RNF185Q96GF1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RNF185Q96GF1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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