Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP36Q96G28 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP36Q96G28 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP36Q96G28 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms