Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TVP23CQ96ET8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TVP23CQ96ET8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms