Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM5Q96DZ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM5Q96DZ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms