Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTUB2Q96DC9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTUB2Q96DC9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTUB2Q96DC9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms